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인두는 해부학적으로 다른 부위의 집합체이므로 각 부위에 발생하는 암의 예후도 매우 다릅니다. 구인두암 중 편도암 특히 사람유두종바이러스(HPV)와 연관된 경우는 그렇지 않은 경우보다 아주 좋은 예후를 나타냅니다. 반대로 하인두암의 경우에는 발견 당시 이미 진행된 경우가 많고, 동반질환이 많은 환자에서 발생빈도가 높기 때문에 두경부의 다른 부위보다 예후가 안 좋은 것으로 알려져 있습니다.
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