진찰만으로는 요도언덕(urethral caruncle), 폴립, 요도점막탈출, 요도곁주머니, 원발성 질종양 등과 감별하기 어렵기 때문에 요도경 검사, 방광경 검사와 조직 생검을 함께 시행하여 확진을 합니다.
남성의 경우 요도경유절제술을 시행하여 뾰족콘딜로마, 폴립 같은 양성병변과 감별진단이 필요합니다. 전립선요도 종양의 진단은 내시경하 조직검사와 경직장 전립선조직검사를 모두 시행하고, 면역화학염색과 같은 특수염색을 통한 원발성 전립선암과의 감별진단이 필요합니다.
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