방사선요법의 부작용은 주로 방사선이 조사된 부위에서 일어납니다. 그 때문에 치료하고 있는 부위에 따라 부작용이 다릅니다.

식도암의 방사선치료 시 심장과 폐가 방사선 조사 부위에 포함되어 있으면 치료가 종료된 후에 이들 장기가 영향을 받기도 합니다. 만성 방사선 폐렴, 심낭염 등이 5%정도 발생되기도 합니다. 그러나 최근에는 방사선의 치료의 기술이 발전함에 따라 암 이외의 부위에는 방사선이 조사되지 않도록 하므로 부작용 발생 가능성이 낮습니다.  

방사선치료의 다른 부작용으로는 목 부위에 방사선을 조사하면 연하시의 불편감, 동통, 인두의 건조, 목이 쉬는 현상이 있으며, 배 부위에 조사하면 복부 불편감, 구역질, 구토, 식욕저하, 설사 등이 있습니다. 또한 방사선을 조사한 부위의 피부에는 햇볕에 탄 것과 같은 증상이 나타납니다. 

이상에서 언급한 증상의 정도에는 개인차이가 있으며 거의 아무런 증상이 나타나지 않는 사람이 있는가 하면 심한 증상이 나타나는 사람도 있습니다. 증상이 심한 경우에는 증상을 완화시키기 위한 치료를 합니다만, 일정한 시기가 되면 자연적으로 회복됩니다.